Буква «У» обозначает «Университет», а ее графическое изображение — специфику отраслевого вуза, то есть развитие, соединение и разветвление путей сообщения.
Цифры 1809 — год основания Университета.
Топор и якорь — символы корпоративного знака. Первая эмблема Главного Управления путей сообщения представляла собой скрещённые топор и якорь. Управление координировало работу всех речных и морских судоходных путей (отсюда и якорь), а также отвечало за мосты (потому и топор, символизировавший инженерную мысль). В 1830 году скрещённые топор и якорь появились на мундирах и сюртуках офицеров и кадетов ИКИПС. С 1876 года эмблема постоянно соседствовала рядом с названием одного из первых в мире отраслевых изданий – «Газеты железных дорог и пароходства». Спустя ещё пять лет она появилась на общем флаге МПС, уютно разместившись в его правой части. А с сентября 1882 года это сочетание сделали отличительным знаком казённых железных дорог. Эмблема, нанесённая на государственный герб, помещалась на продольных стенках пассажирских и товарных вагонов.
Книга — символ учения и знаний, передаваемых от поколения к поколению.
Круглая форма знака, олицетворяет колесо, одно из самых гениальных изобретений человечества в области транспорта.